Raksasa kopi seperti Starbucks dan Tim Hortons secara eksklusif menggunakan biji kopi dari tanaman Arabika untuk menyeduh jutaan cangkir kopi yang mereka sajikan setiap hari. Asal Muasal Kopi Arabika dan Robusta
Namun, sebagian karena rendahnya keragaman genetik yang berasal dari sejarah perkawinan sedarah dan ukuran populasi yang kecil, Arabika rentan terhadap penyakit ini. banyak hama dan penyakit dan hanya dapat dibudidayakan di beberapa tempat di dunia dimana ancaman patogen lebih rendah dan kondisi iklim lebih menguntungkan.
Baca juga: Metode Cara Membedakan Kopi Robusta dan Arabica dalam Secangkir Kopi
Dunia Membutuhkan Kutivar Arabika Baru
Pemahaman rinci tentang asal-usul dan sejarah perkembangbiakan varietas-varietas kontemporer sangat penting untuk mengembangkan kultivar Arabika baru yang lebih mampu beradaptasi terhadap perubahan iklim,” kata Victor Albert, PhD, Profesor Inovasi Empire di Departemen Ilmu Biologi UB, di Fakultas Seni dan Sains.
Dengan alasan itulah para peneliti yang dipimpin oleh Universitas Buffalo menciptakan apa yang mereka sebut sebagai genom referensi kualitas tertinggi hingga saat ini dari spesies kopi paling populer di dunia, Arabika, mengungkap rahasia tentang garis keturunannya yang tersebar selama ribuan tahun disemua benua. Temuan mereka, yang diterbitkan hari ini di Nature Genetics.
Coffea arabica berkembang lebih dari 600.000 tahun yang lalu di hutan Ethiopia melalui perkawinan alami antara dua spesies kopi lainnya, menurut studi tersebut.
Asal Muasal Kopi Arabika dan Robusta
Kopi arabika tanpa bantuan manusia Arabika merupakan sumber dari sekitar 60% total produk kopi dunia, dan benihnya membantu jutaan orang memulai hari atau begadang. Arabika terbentuk sebagai hibridisasi alami antara Coffea canephora dan Coffea eugenioides, yang kemudian menerima dua set kromosom dari masing-masing induk. Para ilmuwan kesulitan menentukan dengan tepat kapan dan di mana peristiwa allopolyploidisasi ini terjadi, dengan perkiraan berkisar antara 10.000 hingga 1 juta tahun yang lalu. Untuk menemukan bukti peristiwa asli tersebut, peneliti UB dan mitranya menjalankan berbagai genom Arabika melalui program pemodelan komputasi untuk mencari tanda-tanda dasar spesies tersebut.
Analisis Genom Sejarah Kopi Arabika
Dari genom referensi baru mereka, yang dicapai dengan menggunakan teknologi pengurutan DNA mutakhir dan ilmu data canggih, tim tersebut mampu mengurutkan 39 varietas Arabika dan bahkan spesimen abad ke-18 yang digunakan oleh naturalis Swedia Carl Linnaeus untuk memberi nama pada spesies tersebut. Genom referensi sekarang tersedia dalam database digital yang tersedia untuk umum.
Persilangan Terbentuknya Arabika Terjadi Secara Alami
Model tersebut menunjukkan tiga hambatan populasi sepanjang sejarah Arabika, dengan yang tertua terjadi sekitar 29.000 generasi atau 610.000 tahun yang lalu. Hal ini menunjukkan Arabika terbentuk beberapa waktu sebelumnya, antara 610.000 hingga 1 juta tahun yang lalu, kata para peneliti. “Dengan kata lain, persilangan yang menghasilkan Arabika bukanlah sesuatu yang dilakukan manusia,” kata Albert.
“Sangat jelas bahwa peristiwa poliploidi ini terjadi sebelum manusia modern dan budidaya kopi.” Tanaman kopi telah lama diperkirakan berkembang di Etiopia, namun varietas yang dikumpulkan tim di sekitar Great Rift Valley, yang membentang dari Afrika Tenggara hingga Asia, menunjukkan pemisahan geografis yang jelas. Varietas liar yang diteliti semuanya berasal dari sisi barat, sedangkan varietas budidaya semuanya berasal dari sisi timur yang paling dekat dengan selat Bab al-Mandab yang memisahkan Afrika dan Yaman. Hal ini sejalan dengan bukti bahwa penanaman kopi mungkin dimulai terutama di Yaman, sekitar abad ke-15. Biksu India Baba Budan diyakini telah menyelundupkan “tujuh benih” yang terkenal itu keluar dari Yaman sekitar tahun 1600, yang kemudian menciptakan kultivar Arabika India dan membuka jalan bagi jangkauan global kopi saat ini.
“Tampaknya keragaman kopi Yaman mungkin menjadi penyebab semua varietas kopi utama saat ini,” kata Descombes. “Kopi bukanlah tanaman yang banyak disilangkan, seperti jagung atau gandum, untuk menghasilkan varietas baru. Masyarakat pada dasarnya memilih varietas yang mereka sukai dan kemudian menanamnya. Jadi varietas yang kita miliki saat ini mungkin sudah ada sejak lama. ” Bagaimana iklim berdampak pada populasi Arabika Sejarah geoklimatik Afrika Timur terdokumentasi dengan baik berkat penelitian tentang asal usul manusia, sehingga para peneliti dapat membandingkan peristiwa iklim dengan bagaimana populasi Arabika liar dan budidaya berfluktuasi dari waktu ke waktu. Pemodelan menunjukkan periode rendahnya jumlah populasi antara 20-100.000 tahun yang lalu, yang kira-kira bertepatan dengan kekeringan berkepanjangan dan iklim yang lebih dingin yang diyakini melanda wilayah tersebut antara 40-70.000 tahun yang lalu. Populasinya kemudian meningkat selama periode lembab di Afrika, sekitar 6-15.000 tahun yang lalu, ketika kondisi pertumbuhan cenderung lebih menguntungkan. Pada waktu yang sama, sekitar 30.000 tahun yang lalu, varietas liar dan varietas yang pada akhirnya dibudidayakan oleh manusia terpisah satu sama lain.
Mereka kadang-kadang masih berkembang biak satu sama lain, namun kemungkinan berhenti sekitar akhir periode lembab Afrika dan pelebaran selat akibat kenaikan permukaan laut sekitar 8.000 hingga 9.000 tahun yang lalu,” kata Jarkko Salojärvi, asisten profesor di Nanyang Technological University di Singapura. dan penulis karya terkait lainnya. Keragaman genetik yang rendah mengancam Arabika Arabika yang dibudidayakan diperkirakan memiliki jumlah populasi efektif hanya 10.000 hingga 50.000 individu. Keanekaragaman genetik yang rendah membuat pisang ini bisa musnah, seperti pisang Cavendish yang bersifat monokultur, karena patogen seperti karat daun kopi, yang menyebabkan kerugian sebesar $1-2 miliar setiap tahunnya.
Robusta Merupakan Kultivar Arabika?
Genom referensi mampu menjelaskan lebih lanjut bagaimana satu galur varietas Arabika memperoleh ketahanan yang kuat terhadap penyakit tersebut. Varietas Timor terbentuk di Asia Tenggara sebagai persilangan spontan antara Arabika dan salah satu induknya, Coffea canephora. Juga dikenal sebagai Robusta dan digunakan terutama untuk kopi instan, spesies ini lebih tahan terhadap penyakit dibandingkan Arabika.
Jadi, ketika Robusta melakukan hibridisasi kembali ke Arabika di Timor, ia membawa beberapa gen pertahanan patogen,” kata Albert, yang juga ikut memimpin pengurutan genom Robusta pada tahun 2014. Pekerjaan Albert dan kolaboratornya saat ini juga menyajikan sebuah versi genom Robusta yang sangat ditingkatkan, serta rangkaian baru spesies nenek moyang Arabika lainnya, Coffea eugenioides.
Meskipun para pemulia telah mencoba mereplikasi persilangan ini untuk meningkatkan pertahanan patogen, genom referensi Arabika yang baru memungkinkan para peneliti untuk menentukan wilayah baru yang menampung anggota keluarga gen resistensi RPP8 serta pengatur umum gen resistensi, CPR1. “Hasil ini menunjukkan adanya lokus target baru yang berpotensi meningkatkan resistensi patogen di Arabika,” kata Salojärvi. Genom tersebut juga memberikan temuan baru lainnya, seperti varietas kopi liar mana yang paling dekat dengan kopi Arabika modern yang dibudidayakan. Mereka juga menemukan bahwa varietas Typica, kultivar Belanda awal yang berasal dari India atau Sri Lanka, kemungkinan merupakan induk dari varietas Bourbon, yang pada prinsipnya dibudidayakan oleh Perancis.
Demikian artikel tentang Asal Muasal Kopi Arabika dan Robusta, semoga dapat menambah refrensi pengetahuan.
Jurnal Refrensi
Victor A. Albert, Dominique Crouzillat, Alexandre de Kochko, Patrick Descombes., etc. 2024. The genome and population genomics of allopolyploid Coffea arabica reveal the diversification history of modern coffee cultivars. Nature Genetics, 2024; 56 (4): 721 DOI: 10.1038/s41588-024-01695-w
Tinggalkan komentar